B2 - Die Rolle von miRNAs in einzelnen Zellen des menschlichen Fettgewebes im Rahmen des E2F1-, Entzündungs- und Autophagie-Netzwerks

Autophagie spielt eine Rolle bei der Entstehung der Fehlfunktion des Fettgewebes. Bei humaner Adipositas steht die aktivierte Autophagie im Fettgewebe auch unter der Kontrolle des Faktors E2F1 und von spezifischen miRNAs. Deshalb soll in diesem Projekt untersucht werden, wie E2F1 zu erhöhter Autophagie des Fettgewebes bei Adipositas beiträgt und welche miRNAs diese E2F1-abhängigen Prozesse regulieren. Dazu sollen die Interaktionen des E2F1-Autophagy-Inflammation-Netzwerks in der Einzelzell-Auflösung und in Relation zu zirkulierenden miRNA-Spiegeln charakterisiert werden. Mittels single-nucleus RNA-sequencing (sNucSeq), sollen Adipozyten-Subtypen der Fettgewebefehlfunktion hinsichtlich des Beitrags einzelner Zellpopulationen an der Entstehung der E2F1-vermittelten Fehlfunktion des Fettgewebes und deren kardiometabolischen Folgen identifiziert werden.

Abbildung 1: Erhöhte humane Fettgewebs-E2F1-Expression und E2F1-mRNA-Stabilität. A. Hierarchische Clusterbildung von unterschiedlich stark exprimierten Genen. Es wird ein unterschiedliches Transkriptom zwischen E2F1hoch und E2F1niedrig gezeigt, geteilt in Cluster von hochregulierten und herunterregulierten Genen. B und C. Ausgewählte Signalweg-Analysen, unter Verwendung der STRING10©Protein-Interaktions-Datenbank. Gezeigt werden prognostizierte und/oder experimentell nachgewiesene Signalwege von ECM-relevanten Genen und TNF-bezogenen Superfamilien-Genen, unterschiedlich stark exprimiert in unserer Kohorte. Die Linienstärke gibt das Konfidenzniveau der Interaktion wider.

 
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PROJEKT TEAM

Tal Pecht, Doktorand

Yulia Haim, Doktorandin